本书从藻类的起源、系统发生与进化的角度探讨藻类分类和相互关系，包括：藻类的定义，藻类分类体系的发展，藻类起源与系统进化，藻类的基本特征和分类概况等，以期为不同读者从一个新的角度来审视和了解藻类学知识。
第一章 藻类的定义
一、藻类的定义
二、藻类的生态分布及类群划分
三、藻类生物类群特征
第二章 藻类分类体系的发展
一、藻类在生物分类系统的地位
二、藻类分类系统
三、分类阶元
四、分类体系理论的发展
五、现代分类学的基本概念
六、现代分类系统
七、国际藻类分类系统与阶元
参考文献
第三章 藻类起源与系统进化
一、真核生物的起源
二、内共生假说的发展
三、藻类的系统进化
四、藻类质体内共生起源假说的主要证据
五、质体次级内共生及囊泡藻界进化假说
第四章 藻类的基本特征
一、藻类的细胞类型
二、细胞核
三、生物膜系统
四、内膜系统
五、中心体
六、细胞骨架
七、质粒
八、线粒体
九、质体、
十、质体的同源细胞器
十一、细胞壁
十二、藻类的细胞间结构
十二、藻类细胞器（鞭毛、纤毛与伪足）
十四、其他细胞器
十五、营养方式与同化产物
十六、藻类体制类型
十七、藻类的繁殖
十八、藻类生活史 参考文献
第五章 藻类分类概况
一、藻类整体分类体系
二、主要类群（高级分类阶元）的特征
三、无质体类群
四、棕色藻门分类及概况
参考文献
第六章 藻类高级阶元分类
一、蓝细菌门
二、维管植物门 泽泻目
三、绿藻门和轮藻门
四、灰色藻门
五、红藻类门
六、丝足虫门
七、隐藻门
八、定鞭藻门
九、眼虫门
十、念孢子门
十一、双环门
十二、真菌门
十三、棕色藻门
参考文献
第七章 藻类的化石记录
一、古地史 环境演变
二、藻类化石的类型
三、藻类的化石记录
四、寒武纪大爆发的假说
五、陆生植物的演化
六、分子钟假说及其应用
七、分子钟与化石记录的联合研究 参考文献
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